Нашел ошибку в игре:
Игрок сажает на свою станцию флот, в трюме которого кристаллит, тринадий, и пр. редкие элементы.
В закладке "ресурсы" базы после посадки флота таких элементов всё равно "0".
При старте флота и последующем перемещении груза на него со станции кристаллит, тринадий и пр. пропадают((